《东京回音：菲尼克斯（Echo Tokyo: Phoenix）》在一次核事件摧毁了大部分的东京之后，一个新的城市诞生了，幸存者们在放射云之上建造桥梁和平台，为了生存和逃离地面的辐射，一千年多年后，城市以某种程度继续存在和生存。shizume是一个侦探，黑暗的东西潜伏在《东京回音（Echo Tokyo）》的世界中，她的工作是调查它们和揭露真相。